第一關 九龍紛爭
一年之後，我輾轉來到香港落腳，有一天筆記本電腦中突然收到一封電子郵件 ，有個自稱控制者的人以黛安娜的落名給我指派了一項任務，沒想到這麼快就繼續幹上了老本行。任務的最終目標是香港本地三合會的頭目李弘，這位黑幫老大不但黑白通吃，而且身邊有眾多裝備精良的幫眾守衛，一時之間要接近他實在不容易。為了趕蛇出洞，黛安娜所代表的總部精心策劃了一系列任務。首先，李弘所在的赤龍幫準備與籃蓮幫在寺廟中談判，如果能幹掉赤龍幫的談判代表無疑會引起一場軒然大波
來到出發點後，快步奔到寺廟附近觀察，看到某座樓側面有一部升降電梯，乘電梯上到樓頂後發現正好可以俯瞰到廟中的情況。此時籃蓮幫的人已經驅車趕到，我迅速打開手提箱把狙擊步槍組裝好。果然，赤龍幫的人不久後從對面的門進入院中，按照任務指示，目標正是那個身上有紅字的傢伙。打開狙擊步槍的瞄準鏡套住這小子，他走到院中的台階上與籃蓮幫代表搭上了話，趁這傢伙停下不動的瞬間我嫻熟地扣動了扳機。目標當場斃命，鮮血濺了籃蓮幫代表一身。我趕緊扔下槍跳上電梯下樓飛奔，這時有一架壞蛋們的直升飛機也趕來湊熱鬧。如果我心情好一點的話也許可以把艙口拿重機槍狂掃的那個惡棍射下來，但他卻不是我的目標，因此我一路飛奔到接應汽車那裡撤出了現場。
第二關 汽車炸彈
赤龍幫和籃蓮幫的梁子算是結下了，但我還需要給火上再添一勺油。籃蓮幫再次派人到李弘的老巢王福飯店談判，我通過電腦訂購了汽車炸彈和鋼琴弦。很快來到王福飯店門口，籃蓮幫的談判人員進入飯店後，我繞著他們的房車打注意，沒想到有個守衛看得很緊，根本沒法下手。突然，我發現房車司機居然拐進了旁邊的小巷，機會來了！果然，這傢伙溜到下水道口處隨地撒尿，讓我來代表市容管理處懲罰他吧。鋼琴弦勒進脖子時幾乎沒有發出什麼聲音，由於附近仍有閒人出沒，我拖起他的屍體趕緊跳進了下水道中。在黑暗中我換上了司機的衣服，並小心翼翼地收起了手上的凶器，然後從梯子爬上地面。那個傻瓜守衛果然沒有註意到司機調了包，我來到左邊信手扭開車門把炸彈裝了進去，隨後趕緊跑到撤退點的街對面。這裡可以看到左面閒逛的幾個籃蓮幫分子，不久談判結束了，房車返回途中朝那邊開去，我猛地一摁遙控引爆鈕，整輛汽車和路邊的四個籃蓮幫分子全都融化在火光和煙霧中。
第三關 小店屠戮
在警界也有許多和李弘狼狽為奸的不良分子，其中最突出的莫過於一位高級警司。他打算安排赤龍幫和籃蓮幫在一家小麵店內談判以消除彼此間的誤會，我們當然也不能坐失良機。買了一支貝雷塔消聲手槍和鋼琴弦後，我乘車來到現場。朝左徑直來到紅色的小麵店，與老闆攀談得到廁所鑰匙，進衛生間把消聲手槍丟在地上後離開。迅速趕到地圖的東北角，街道盡頭可看見身著赤龍幫會服的一個傢伙悠然而來。跟著他走一段路後可以看到路的右邊有一個下水道口，附近巡邏的警察也正好走開，這可是天賜良機。摸出鋼琴弦乾淨利落完了事，然後拖著屍體跳進下水道口，換衣並從這個倒霉鬼身上拿走項圈，當收起武器再走上地面時我已經是赤龍幫的談判代表。
麵店內的高級警司和籃蓮幫談判者已等候多時，門口的警察仔細搜身後才讓我進去，雖然警司對我居然是白種人表示驚奇，但我的一番話語略微打消了他的顧慮。我先把赤龍幫的項圈拋在地上，然後藉口要上廁所，事先藏匿的手槍仍然在那裡。默默數到三時我打開了門，外面那兩個人的表情簡直像見了鬼。我總共開了四槍，甚至沒有驚動外面把門的警員。丟下手槍，我轉身返回衛生間，從窗戶翻了出去，落地之後還撣了一下西裝上的灰塵，接著大步向接應車輛奔去。
第四關 刺殺李弘
李弘的保護層被我們逐漸剝個精光，再也沒有警察能夠庇護他了，籃蓮幫與赤龍幫的衝突也早已逾越了臨界點，現在是拔掉最後一根釘子的時候了。我知道這個任務不輕鬆，但還是僅帶了一根琴弦。王福飯店的大門終於向我敞開，進門往前走一小截就看見一個梳日式髮髻的保鏢獨自站在一扇儲物室的小門前，等巡邏的女保鏢走過後，我用鋼琴弦結束了他罪惡的一生並閃電般地將屍體拖進儲物室中。身著保鏢制服的我出門後從容地拾起落在地上的手槍，同時還沒忘記向走回來的女保鏢報以一記曖昧的微笑。從櫃檯的酒保那裡得到了一張宣傳單，憑著它我順利進入了大門右側有兩人把守的娛樂區。在樓上的妓院中經老鴇介紹認識了一位姑娘，一番談話後我答應幫助她逃跑，作為回報她告訴我李弘保險櫃的密碼和地下室關有CIA情報人員的秘密。
掩護這位姑娘逃脫後，我又回到了大廳裡，沿著老路很快找到了漆黑的地下室。即使是如此昏暗的地方也仍有大批衛兵把守，看來還真有貓膩。找到一處合適的藏屍點後我先勒死了游動哨，然後是囚室門口的衛兵，裡面果然是一位被俘的CIA特工，他告訴了我藏有真正玉璽的保險櫃位置， 我費勁周折找到保險櫃後用那位姑娘給我的密碼得到了玉璽，大廳附近一間像是藥店的鋪子裡有位老人正需要這件古董，作為回報他塞給我一瓶毒藥並讓我設法毒殺李弘的那位巨人貼身保鏢。在休息室我幹掉了一位不幸的侍者，換上他的衣服後到廚房裡抬了一碗湯，同時還在裡面加了點東西。忠心耿耿的巨人保鏢搶著替李弘品湯，這成了他喝的最後一碗湯。
混亂中我趁機溜走，回到地下囚室換上赤龍幫的紅色制服，在附近仔細查看可以找到一支AK47和許多彈藥，還有一條通道可前往李弘的遁身之處。乘電梯上去之後在樓上可找到這位曾經不可一世的傢伙，一梭子掃倒他後要用心對付不斷湧上來的衛兵們。至少殺了十來個人後，我下樓乘屋角的另一座電梯降到碼頭上。這裡唯一的一個衛兵根本擋不住我手中的AK47，我跳上快艇告別了香港。
第五關 烏瓦部落
新的戰場在哥倫比亞，有人想為大毒梟帕布羅的輝煌生涯畫個句號。不過帕布羅的營地一直隱藏在密林中某個無人知道的地點，可能只有當地的印第安人才知道。最近帕布羅偷走了烏瓦部落的神像，把神像掏空後用來裝運毒品，但裝神像的飛機卻墜毀在林中某處，這就是我們的唯一機會。從飛機上下來後我仔細地看了一遍地圖，按照上面的指示我很快潛到墜機點附近，把守這裡的壞蛋們依舊一個個倒在琴弦的愛撫之下，站在機翼上的那傢伙也被我眼明手快一槍摞倒。在半截機艙的門口我找到了那個神像，接著迅速跑到河邊，印第安人的村落就在這裡，他們的酋長對我送回神像深表感謝，同時他還請我去救被毒品販子們抓住的兄弟。在地圖下方可以看到一座跨河的大橋，酋長的兄弟就被押在那裡，附近共有六個持槍的壞蛋。叢林中很多地方還散佈著彈藥，我端著新得到的M60機關槍把他們掃成了馬蜂窩，幸好沒有傷及無辜。跟著被救的印第安人我又回到了村落中，這回酋長終於對我吐露了實情。
第六關 叢林之神
在印第安人的神殿附近有一條秘道通向帕布羅的大本營，但酋長警告我秘道入口有偉大的神靈守護，根據我們的資料分析，那顯然是一隻巨大的美洲虎，即使是機關槍也無法瞬間結果它。我先悄悄繞過吊橋附近的守衛進入廢墟遍布的神殿區，根據地圖上的指示，秘道入口就在南面。為了不驚動更多的敵人，我沒有殺一個人，很快摸到秘道附近時停了下來，雖然已經隱約看到了入口，但估計再上前那位叢林之神就會扑出來迎接我。我輕輕地潛到右側，這裡靠懸崖處有一截短牆，借助它爬上山崖，然後緩緩下到入口處，趁那隻老虎的爪子還沒有落到肩上我一頭鑽進了秘道。
第七關 迎戰毒梟
帕布羅的營地果然守衛森嚴，三步一哨五步一崗，還有星羅棋布的塔樓，上面的哨兵隨時會抬起手中的AK47開火。開始先往左邊走到遠離哨塔的地方，很快會有三個巡邏兵從右邊而來，用霰彈槍迅速解決他們，把屍體拖進林中並換上衣服。繞到鐵絲網牆的入口處進入了毒梟的大本營，中央位置的一棟豪宅顯然是帕布羅的住所，我進去後先上樓。在樓道左側一間小屋內有個傢伙在打盹，我掏槍斃了他，眾多衛兵聞聲而來都被我逐個消滅。等到再沒有人來找麻煩了，我才跨過屍堆出去開樓道中間的那扇大門，帕布羅正在桌子後面，抱著他的M60還不停的嘲笑我，我不是個善言辭的學者，回答他的只有密集彈雨。打死了這個小丑後我拾起屋角裝炸彈的箱子，一出豪宅就開始飛奔，已經被驚動的守衛紛紛向我開槍。沿著車軲轆印衝到地下實驗室的入口處，守門的衛兵尚未開口已經倒在血泊中，我踹開門後又是一陣狂掃，把炸彈放在了炸藥箱上，接著從另一個出口殺了出去。機庫在地圖的東面，我雖然中了幾槍，但仍然活著到了那裡。在爬上飛機的瞬間我按下了遙控引爆鈕，甚至來不及欣賞那地動山搖的場面就發動飛機逃離了這片罪惡的土地。
第八關 行有行規
在布達佩斯的熱浴賓館將召開舉世矚目的和平會議，奧地利恐怖分子弗朗茲福斯準備在這裡引爆炸彈，我們的目標是搶在這個瘋子的前面乾掉他並拿走炸彈，同時還可以在各國要員面前展露一下我們的風采。考慮到賓館中有很多金屬探測門，我只帶上了鋼琴弦。在接待台我簽到時發現弗朗茲以化名住在202房。先到一樓澡堂裡去，換上衣服使我看起來更像一個來洗澡的普通人。在桑拿蒸汽室裡有個穿紫色內褲的胖子，把外面的蒸汽閘閥扭開很快就送他上了西天，從屍體上得到牙醫照光室的鑰匙。穿上衣服返回大堂，上二樓右邊的門，沿著走廊一直前行，注意途中如果遇到推吸塵器的侍者一定要把他留在門上的萬能鑰匙偷走。終於到了202房，弗朗茲的一個手下緊貼著門口把守，我只得溜到201房，從陽台上跳到202的陽台，輕輕開門潛入屋內將保鏢勒死，然後換上他的衣服，拿起桌上謝絕打擾的標誌牌。打開門將外面的保鏢勒死，把屍體拖進來並把謝絕打擾的牌子掛在門上。
這時再用桌子上的消聲手槍打死浴室裡正在沖涼的弗朗茲，最好對準頭部射擊以免他的慘叫驚動其他客人。從屍體身上搜走鑰匙和信件，接著把床邊原先裝炸彈的空箱子拿到。把所有的屍體全部拖進浴室然後通過綠門後的樓梯上到三樓，為避開金屬探測器我來到了房頂，從左邊有扇窗子爬進牙醫辦公室。守在辦公室的恐怖分子被我用消聲手槍射殺，然後我丟下手槍徑直到照光室裡把炸彈裝入箱子中。考慮到一經過金屬探測門手上提的炸彈就會讓我成為眾矢之的，仔細察看地圖一番後我順利從廚房離開賓館，剛到街面上就迎來了接應車輛。
第九關 軍火天堂
一切證據都表明，在李弘和帕布羅的背後有人為他們提供軍火，而這個販賣武器的傢伙就是臭名昭著的國際軍火商鮑里斯。鮑里斯躲藏在停泊於鹿特丹的輪船上，荷蘭本地的幫派最近準備向他購買一批軍火，我們正好可以藉機找到他的準確地點。在碼頭我先勒死了一個流氓，把屍體藏在左邊暗處後換上了他的衣服。在附近找到道閘並扳下後信步來到酒吧，與酒保談話中得知可以在化妝室找到艷舞女郎，花點錢讓她去勾引門外看車的保鏢，趁機把GPS定位器放到車上。酒吧里的傢伙出來後與保鏢乘車離去，通過定位器可以找到他們。如果他們最後停在中間，直接往南走就行；如果去了左邊要到地圖北面去扳道閘；如果是右邊要去南面扳道閘。從車上拆下GPS定位器，到倉庫裡先掏出消聲手槍打死了討厭的狗，接著用消聲衝鋒槍解決掉等在這裡的惡棍們，為他們料理完屍體後在此等候接頭人伊万的光臨，注意要先把定位器放入裝錢的手提箱中，千萬不要讓他看到屍體。
第十關 核子武器
我們要趕緊動手，因為鮑里斯可能要逃離鹿特丹，聽說他在船上還藏有一枚原子彈，不過型號較老，拆除起來應該不困難。從梯子爬上碼頭後遠遠看見倉庫角上站著一個衛兵，勒死這傢伙後又掏出貝雷塔消聲手槍放倒了靠近過來的巡邏兵。換上衣服後來到有兩個衛兵把守的鐵絲網門前，先把進進出出的另外兩個游動哨勒死在水邊暗處，然後摸到倉庫側梯上用消聲手槍把屋頂上的哨兵一槍射倒，這時再上前一陣無聲的狂射消滅把門的兩衛兵。進門後依次還有幾道類似的關卡，只要動作快即便用MP5或M16都不會暴露行踪，關鍵是不能讓敵人報警。在碼頭的東南角有一輛長櫃貨車，裡面有大量武器，其中的汽車炸彈非常有用，最好能搞到。繞回中央的泊位上靠近貨輪，在倉庫後面停著的白色房車是鮑里斯的，幹掉守衛後給它安上汽車炸彈。
然後儘快到登船舷梯下面勒死一名船員並換上他的衣服，上船後搜尋核子彈頭，如遭遇盤查可主動開火。鮑里斯要是逃跑也不必管，這個惡貫滿盈的傢伙進車後一扭點火鑰匙就會升天。但他逃跑時會啟動核彈在一分鐘內爆炸，所以我全部心思都用在了搜索上，幾乎沒有任何敵人能擋住我的去路，功夫不負有心人，我在千鈞一發之際終於找到了核彈，而計時器只剩下最後十秒鐘。拆卸完成之後我才開始清剿船上的餘匪，把這些人渣全部消滅後我來到船長室駕船駛向公海。
第十一關 陰謀詭計
總部發來消息，原來此前的四次任務都是同一位顧客的委託，他這次又交給我們另外一個任務，那就是去刺殺柯瓦克斯教授。這位詭秘的顧客同意把這單生意列為最後的一次買賣，但他竟然指名要我，47號殺手前往執行，看來我的人氣度很高嘛。沒有攜帶任何武器的我進到樓里後，接待台後的男人放我進到大廳中，先從右邊的雙開門上到書房裡找到一把烏茲衝鋒槍。隨後來到目標的辦公室中，發現這果然是一個圈套！拿走牆上掛著的鑰匙，然後跑出去得到霰彈槍，與聞訊趕來的特種部隊發生激戰。下樓進入有一座教授雕像的房間，很快我還遇到了一位坐在輪椅裡的男人，看來他需要一點解毒劑。在有鐵柵欄的地方可以找到解毒劑，這位病人服下後似乎康復得很快，他帶著我上了電梯，前面尚不可測的命運在等待著，我怎麼會猶豫呢，不過這座房子裡的一切看起來似乎總有點那麼熟悉......
第十二關 手足相殘
寂靜中，我又嗅到了一絲熟悉的空氣，走了兩步之後我終於恍然大悟，原來這裡就是我當初逃離的那座奇怪的監獄！在附近的屋子裡我先找到了一些武器彈藥，幹掉了幾個獄卒後突然閃現出許多和我一模一樣的殺手，他們的身手和槍法都和我的風格酷似，不過這些“兄弟”的目標顯然是我。到底是誰欲置我於死地而後快？激烈的槍戰之間我閃進了幾間實驗室才發現，那些巨大的玻璃容器中還有不少和我外形相似的人造人，想不到我竟然是一個科學技術克隆出來的生化人！憤怒之餘我摞倒了一個又一個襲來的同類，衝過一扇大門後，我們的創造者——柯瓦克斯教授出現了，這個自命為父親的傢伙準備親自向我動手，我知道如果被他擒住我的一切又要從頭開始，於是我只剩下唯一的選擇：端起轉管機關槍向他扣動了扳機。
